Arlequin软件介绍。

Arlequin官方版是一款十分受欢迎的人类遗传学数据分析工具,Arlequin官方版界面美观大方,功能强劲实用,支持AMOVA计算、中性检验、错配分布等功能,使用起来简单便捷,可以满足大家的工作所需。

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软件介绍

Arlequin官方版是一款专业的人类遗传学数据分析软件,通过对统计数据中信息的挖掘,可进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等,为从事医学和生物学研究的朋友提供了参考方案,比较遗憾的是软件没有汉化版,使用起来可能稍微有些吃力!

软件功能

1、Molecular diversity(分子多态性)

2、Mismatch distribution(错配分布)

3、Haplotype frequency estimation(单倍型频率估计)

4、Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关联)

5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格平衡)

6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验)

7、Fu`s neutrality test(Fu中性检验)

8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验)

以上三个中性检验都是基于无限位点模型,适用于DNA sequence 和 RFLP单倍型。

9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s
融合检验,检测人群的均一性或同质性和中性选择等)

10、Minimu Spanning Network(MSN,最小扩张树或称之为最小支撑树,,基于分子差异)

11、AMOVA 分子差异度分析,用以评测人群的遗传结构

12、Pairwise genetic distances (遗传距离的估计)

13、Exact test of population differentiation (检测随机交配群体单倍型的非随机分布)

14、Assignment test of genotype (通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中)

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